HCL papar
题目:Construction of human cell landscape at single-cell level
科学问题:如何构建人类细胞图谱
实验:用其自己开发的Microwell-seq,该研究充分利用Microwell-seq成本低廉,双细胞污染率低和细胞普适性广等优势,建立了70多万个单细胞的转录组数据库,鉴定了人体100余种细胞大类和800余种细胞亚类。基于该数据库,团队开发了scHCL单细胞比对系统用于人体细胞类型的识别,并搭建了人类细胞蓝图网站http://bis.zju.edu.cn/HCL/(国家基因库镜像https://db.cngb.org/HCL/)。
分析:“tSNE+图聚类”(fig1b,fig1c,fig1d); EC,Epi, Stromal cell分泌Ligand的能力(Fig2c)主要是Adult的细胞(微环境?);路径分析(Fig3);调控分析(Fig4)
讨论:图谱式工作;证明了概念的可行性;但是不如HCA那么激动人心?